Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIPCQ9C0C6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIPCQ9C0C6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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