Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms