Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms