Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2AFJQ9BTM1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms