Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms