Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms