Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX13Q92968 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms