Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCSTNQ92542 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms