Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PIK3C3Q8NEB9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3C3Q8NEB9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms