Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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