Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SMIM29Q86T20 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms