Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC36A4Q6YBV0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms