Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms