Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms