Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms