Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms