Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SFT2D3Q587I9 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms