Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PDLIM3Q53GG5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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