Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms