Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms