Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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KRTAP21-3Q3LHN1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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KRTAP21-3Q3LHN1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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KRTAP21-3Q3LHN1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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KRTAP21-3Q3LHN1 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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KRTAP21-3Q3LHN1 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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KRTAP21-3Q3LHN1 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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KRTAP21-3Q3LHN1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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KRTAP21-3Q3LHN1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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