Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWISTNBQ3B726 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWISTNBQ3B726 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms