Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FHOD3Q2V2M9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FHOD3Q2V2M9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FHOD3Q2V2M9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FHOD3Q2V2M9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FHOD3Q2V2M9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms