Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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COL24A1Q17RW2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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COL24A1Q17RW2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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COL24A1Q17RW2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL24A1Q17RW2 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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