Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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PTPROQ16827 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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PTPROQ16827 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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PTPROQ16827 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PTPROQ16827 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PTPROQ16827 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PTPROQ16827 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PTPROQ16827 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PTPROQ16827 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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