Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ZNF239Q16600 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ZNF239Q16600 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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