Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms