Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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