Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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SSX1Q16384 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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SSX1Q16384 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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SSX1Q16384 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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SSX1Q16384 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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SSX1Q16384 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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SSX1Q16384 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
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