Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
USF2Q15853 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
USF2Q15853 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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