Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF4Q15306 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF4Q15306 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms