Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCF4Q15080 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms