Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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CKAP5Q14008 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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CKAP5Q14008 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CKAP5Q14008 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CKAP5Q14008 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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