Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOFQ13790 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APOFQ13790 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOFQ13790 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOFQ13790 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOFQ13790 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOFQ13790 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOFQ13790 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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APOFQ13790 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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APOFQ13790 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOFQ13790 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOFQ13790 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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APOFQ13790 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
APOFQ13790 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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APOFQ13790 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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APOFQ13790 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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APOFQ13790 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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APOFQ13790 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOFQ13790 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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