Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF5Q13568 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms