Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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NAE1Q13564 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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NAE1Q13564 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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NAE1Q13564 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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NAE1Q13564 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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NAE1Q13564 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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NAE1Q13564 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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NAE1Q13564 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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NAE1Q13564 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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NAE1Q13564 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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NAE1Q13564 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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