Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms