Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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