Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SGCGQ13326 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SGCGQ13326 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCGQ13326 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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