Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CBX3Q13185 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CBX3Q13185 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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