Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM32Q13049 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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TRIM32Q13049 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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TRIM32Q13049 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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TRIM32Q13049 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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TRIM32Q13049 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM32Q13049 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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