Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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