Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CHD3Q12873 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CHD3Q12873 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CHD3Q12873 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CHD3Q12873 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CHD3Q12873 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CHD3Q12873 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHD3Q12873 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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