Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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