Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms