Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPAL4Q0D2K0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms