Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM27E3Q08E93 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms