Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms