Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms