Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms